Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HCC1Q9Y3T6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms