Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF11Q9Y3C5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF11Q9Y3C5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms