Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1DQ9Y2S0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms