Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B3Q9UQQ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2B3Q9UQQ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms