Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP2BQ9UQN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms