Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAPRE3Q9UPY8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms