Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4Q9UP95 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4Q9UP95 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms