Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL4

ING4, Inhibitor of growth protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING4Q9UNL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING4Q9UNL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING4Q9UNL4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms