Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PADI4Q9UM07 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI4Q9UM07 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms