Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP2Q9ULQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP2Q9ULQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP2Q9ULQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP2Q9ULQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms