Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD8Q9UKU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAD8Q9UKU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAD8Q9UKU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms