Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCND3Q9UK17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND3Q9UK17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms