Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF2Q9UK05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF2Q9UK05 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF2Q9UK05 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms