Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf18Q9UK00 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf18Q9UK00 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms