Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPN4Q9UHM6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms