Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms