Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTRF1LQ9UGC7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTRF1LQ9UGC7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms