Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms