Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTI1BQ9UEU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTI1BQ9UEU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms