Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC6Q9UBN7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC6Q9UBN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms