Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL42Q9P2K6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms