Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS18Q9P253 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS18Q9P253 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms