Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms