Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms