Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNIH4Q9P003 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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