Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms