Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN3Q9NZ94 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms