Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK4Q9NYG8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms