Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED29Q9NX70 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms