Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJC28Q9NX36 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms