Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4GQ9NTN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4GQ9NTN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4GQ9NTN9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4GQ9NTN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4GQ9NTN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4GQ9NTN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4GQ9NTN9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms