Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREX1Q9NSU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREX1Q9NSU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX1Q9NSU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms