Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms