Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTG1Q9NSN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms