Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 518.37■□□□□ 0.534e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.224e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 416.21■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 215.2■□□□□ 0.024e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 514.91□□□□□ -0.024e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 213.89□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 EML2-221ENST00000590018 551 ntTSL 323.7■■□□□ 1.384e-9■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 326.61■■□□□ 1.852e-8■■■■■ 33.3
DROSHAQ9NRR4 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 530.91■■■□□ 2.548e-7■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 PARK7-206ENST00000465354 949 ntTSL 222.03■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-217ENST00000553009 567 ntTSL 320.97■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 417.79■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 517.46■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 516.37■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-203ENST00000548076 367 ntTSL 513.09□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 539.25■■■■□ 3.876e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.416e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.396e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.216e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.246e-10■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.694e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.694e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-201ENST00000269361 1088 ntTSL 527.3■■□□□ 1.965e-16■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 219.17■□□□□ 0.665e-16■■■■■ 33.2
DROSHAQ9NRR4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.783e-7■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 226.15■■□□□ 1.787e-7■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 ANKS6-205ENST00000471846 1103 ntTSL 236.5■■■■□ 3.432e-7■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 435.65■■■■□ 3.32e-11■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 319.78■□□□□ 0.762e-11■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-11■■■■■ 33.1
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-211ENST00000492545 634 ntTSL 536.3■■■■□ 3.42e-6■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.057e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-205ENST00000564227 903 ntTSL 335.25■■■■□ 3.233e-7■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.018e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.598e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-212ENST00000568287 839 ntTSL 530.66■■■□□ 2.53e-7■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 230.53■■■□□ 2.483e-7■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-204ENST00000575894 1728 nt27.8■■■□□ 2.048e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.998e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MTHFD1L-202ENST00000367308 996 ntTSL 526.73■■□□□ 1.878e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 226.63■■□□□ 1.859e-9■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 DCAF15-206ENST00000591802 506 ntTSL 326.53■■□□□ 1.848e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 525.7■■□□□ 1.718e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.678e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.648e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 325.14■■□□□ 1.618e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 324.66■■□□□ 1.549e-9■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 CORO7-217ENST00000572666 1237 ntTSL 524.54■■□□□ 1.528e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)24.24■■□□□ 1.478e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 SDC3-203ENST00000471567 589 ntTSL 323.45■■□□□ 1.348e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-203ENST00000563136 470 ntTSL 423.33■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.218e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.128e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 CORO7-226ENST00000575531 2636 ntTSL 221.01■□□□□ 0.958e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 220.94■□□□□ 0.948e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 219.76■□□□□ 0.758e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-213ENST00000544448 2090 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 218■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 518■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-216ENST00000613907 1070 ntTSL 517.17■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 LUZP1-205ENST00000475164 613 ntTSL 516.41■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MAN1B1-211ENST00000540391 3940 ntTSL 215.26■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 HAX1-209ENST00000492550 733 ntTSL 514.6□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 HAX1-205ENST00000459914 726 ntTSL 513.9□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-213ENST00000511724 1063 ntTSL 513.72□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-212ENST00000511022 765 ntTSL 513.65□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.38e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 NQO2-208ENST00000426637 626 ntTSL 512.96□□□□□ -0.338e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.588e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 33
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