Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR9Q9NR96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms