Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLDQ9NQC7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms