Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSU72Q9NP77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms