Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC4Q9NNZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms