Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-5Q9HDB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVK-5Q9HDB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms