Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms