Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK4Q9HAZ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms