Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms