Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP1Q9H902 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
REEP1Q9H902 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
REEP1Q9H902 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP1Q9H902 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP1Q9H902 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms