Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOX17Q9H6I2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms