Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF3Q9H4W6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF3Q9H4W6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF3Q9H4W6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms