Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRN3Q9H3W5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN3Q9H3W5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms