Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIOBPQ9H2D6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOBPQ9H2D6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms