Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
B3GNT4Q9C0J1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3GNT4Q9C0J1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms