Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POLDIP3Q9BY77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLDIP3Q9BY77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms