Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HIRIP3Q9BW71 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms